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10月3日に、motoyさんは書きました。

＞「スクリプトヘッダーが早く終わりすぎている。」
＞という直訳になりますが、私には何が何だかさっぱり分かりません。

もしかしたらスクリプトをサーバーにFTPする際に、
オードモードか、バイナリモードで転送されませんでしょうか？
明示的にアスキーモードで転送したらどうでしょう。

それかスクリプトの1行目から  #!/usr/bin/perlなどとせず、
空白行が入ってしまっているとか・・・

それから、スクリプト本体ではなく、requireして読み込んでいる
他のスクリプトの方が、バイナリモードで送られていることもありますので、
そちらも確認してみてはどうでしょう。