メールソフトの併用は可能ですが、若干の変更と制限があります。
アドレス帳はOutlook 2000のプログラムに置き換わります。それから、ホームページにあるメールアドレスのリンクをクリックしたとき、起動するメールソフトもOutlook 2000のメッセージ作成画面になります。これはパソコンの標準のメールソフトがOutlook 2000になってしまうからです(アドレス帳に付いても同じ)。
標準のメールソフト、標準のアドレス帳を切り替える方法はあります。IEのプロパティで[プログラム]タブを開き、[電子メール]と[連絡先一覧]の設定を変更すればいいのです。

あとからOutlook 2000や9xをインストールして、OEが不安定になるという話はたまに聞きます。症状としては「リンクをクリックするとC:ドライブが開く」とか…。ご参考に!